Auch in Chemie hat sich in den letzen 5 Jahren das Netz mit Information gefüllt. Wieder sind die amerikanischen und englischen Internet-Seiten vorbildlich.
In den letzten 15 Jahren hat es mir vor allem die 3D-Struktur biologischer Moleküle angetan, um den Schülern eine bessere Vorstellung von Molekülstrukturen zu verschaffen.
Nach Fertigstellung des Biokurses wollte ich eigentlich nicht dasselbe mit Chemie machen habe aber doch ab dem Schuljahr 2001/2002 den Rappel bekommen und begonnen den Chemiekurs Klasse 11 zu schreiben.

  1. Chemiekurs Klasse 11
  2. 3D-Molekülanimation
  3. Links Chemie/Ernährungslehre

Der Chemiekurs ist wie der Biokurs aufgebaut: praxis- und technikorientierte Inhalte gegliedert nach dem Lehrplan der beruflichen Gymnasien in BW, Trainingsmöglichkeiten wie Stichwortlisten, Glossare, Automatische Tests, Kreuzworträtsel.

Themen: Energie und Materie, Atommodelle und PSE, Bindungen, Reaktionskinetik, Protolysen, Redoxreaktionen.

 

  Molekülanimation:
 

Im Biologie und Chemie-(Ernährungslehre)lehrplan des beruflichen Gymnasiums soll die Proteinstruktur vermittelt werden. Dazu eignet sich ein Computermodell hervorragend. 3D-Molekülanimatoren stellen ausgewählte Moleküle dreidimensional dar und läßt sie durch Mausclick drehen. Es gibt im WWW mehrere Möglichkeiten Moleküle (vor allem komlexe) zu visualisieren:

1. Mit dem Browser-Plugin CHIME,
2. mit RASMOL (s.unten)
3. oder anderen Molekül-Viewern (s. unten)

1. Mit dem CHIME-Plugin können online oder offline Moleküle und Stoffwechsel-abschnitte wie Glycolyse animiert werden. Das Plugin kann unter dem Communicator und Internet-Explorer verwendet werden. Unter nachfolgender Adresse kann man es herunterladen.

CHIME-Support: http://www.mdli.com/support/chime/chimefree.htm
(CHIME-Update für IE 5.5!!!)

Einige wichtige Moleküladressen sind:

Quellen zu 3D-Molekülanimationen Online

Biomoleküle

http://www.nyu.edu:80/pages/mathmol/library/life/life.html

Biochemie

http://colossus.chem.indiana.edu/supplement.html

Molekülanimationen

http://www.leeds.ac.uk/bionet/animation/mol_anim.htm

Molekül-Museum

http://topaz.kenyon.edu/depts/bmb/chime/gallery.htm

Moleküle

http://c4.cabrillo.cc.ca.us/

Index Biomoleküle:

http://www.umass.edu/microbio/rasmol/tutbymol.htm
http://www.umass.edu/microbio/rasmol/edsites.htm

Molekul-Daten für Chime:

http://www.umass.edu/microbio/rasmol/whereget.htm

Daten für Molekulargenetik

http://ndbserver.rutgers.edu/NDB/NDBATLAS/index.html

Enzym-Daten:

http://molbio.info.nih.gov/cgi-bin/pdb/doc/mrus/searching.html

Protein-Daten:

http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/data/scop.1.html

2. 3D- Molekülanimator RASMOL für komplexe Moleküle Proteine, Nukleinsäuren, Kohlenhydrate usw. (PDB-Format)

Es können im Menü DISPLAY mehrere Darstellungsformen gewählt werden und das aktuelle Molekül kann gedruckt werden. Über das Menü FILE/INFORMATION können außerdem noch Informationen zum dargestellten Molekül abgerufen werden. Die Funktion CHAIN aus dem Menü COLORS stellt Quartärstrukturen mit unterschiedlicher Farbe dar.

Herunterladen und Installation: Rasmol samt Beispiele herunterladen (1MB)
RASMOL muß nicht installaiert werden. Kopieren Sie RASMOL in ein beliebiges Verzeichnis und sorgen Sie dafür, daß RASMOL (raswin32.exe) als Anwendungsprogramm von Ihrem Browser Netscape gestartet wird ( unter Optionen/Allgemeine Einstellungen/Anwendung starten). Sie müssen weiterhin unter Netscape einen neuen Dateityp mit dem Namen " ent " erstellen ( Neuen Typ erstellen: MIME-TYP: image ; MIME-Untergruppe: ent ) und RASMOL als extern zu startendes Programm zuweisen. Nun können Sie die folgenden Moleküle betrachten.

In der folgenden Tabelle habe ich einige didaktisch interessante Stoffe zusammengestellt.

Aminosäuren/Peptide
Proteine
Nukleinsäuren/KH/Sonstiges

Glucagon (Helixstruktur)

Cytochrom B562 (Proteid)

DNA synthetisch, Ausschnitt

Mellitin (Helixstruktur)

Cytochrom C (Proteid)

t-RNA Phe (L-Form)

Insulin (Globulärstruktur)

Katalase (Tertiärstruktur mit Helix, Faltblatt und NADP)

t-RNA Asp (L-Form)

Relaxin (Tertiärstruktur)

Myosin (Helix)

Agarose (Oligosaccharid)

Tetrapeptid (Primärstruktur)

Hämoglobin (Quartärstruktur)

 Galactose (Monosaccharid)

 

Urease (Tertiärstruktur)

 

 

CRO-Repressor

 

 

Hexokinase (Tertiärstruktur mit Inhibitor)

 

Myoglobin (Proteid mit Häm)

 

 

Bacteriochlorophyllprotein (Tertiärstruktur mit Faltblatt)

 

Ca. 100 Moleküle finden Sie hier:

3. Hostbasierte PDB-Browser (je nach Netzgeschwindigkeit unregelmäßige Animation)

Eine Unzahl kleiner Moleküle findet man in : http://www.ibc.wustl.edu/moirai/klotho/compound_list.html

 

Weitere Informationen zum Thema "komplexe Moleküle in 3D" siehe BIOKURS 2001 !!!!


Chemie/Ernährungslehre am EG in Baden-Württemberg

Für die Nutzung der Chemie-Power aus dem Internet sollten folgende Browser-Plugins installiert sein:

 

Chemische Suchmaschinen
ChemSpy
Chemische Suchmaschinen

Chemie-Software
Bei der hier empfohlenen Chemiesoftware wurde auf Qualität, freie Verfügbarkeit und Internettauglichkeit Wert gelegt:

CHIME Freeware
Tutorial, Tips, Hilfsprogramme dazu
Molekülviewer und Animationsgenerator
 
ACD/Chemsketch 4.5 Freeware Chemisches Zeichen- und Grafikprogramm
ChemWeb 3.1 Chemisches Zeichenprogramm
ChemLab Interaktive Chemielabor-Simulation
GraphPad Datenanalyse Software

PSEs
Rutherford Eines der besten PSEs Online
Linkliste von PSEs ca. 30 verschiedene PSEs für alle Geschmäcker
   
Nomenklatur  
IUPAC Homepage  
IUPAC-Nomenklatur  
Nomenklatur der Kohlenhydrate  
Organ. Nomenklatur  

Stoff- und Strukturdatenbanken
PDB-Datenbank > 13000 Proteine, DNA und Kohlenhydrate in 3D
Chemikalien Lexikon Chemikalienlexikon von Thomas Seilnacht
ChemFinder Chemie Web-Suchmaschine >75 000 Stoffe/Daten
ChemLin Alles zur Chemie in Datenbanken
C4 Computers at Cambrillo College Interaktive Moleküldatenbank (Chime) ca. 400
Chemdex sehr gute Datenbank für alle chem. Infos
Molecular Models >1350 3D Molekülmodelle mit Chime
Klotho: Biochemicals Database > 449 biochemische Stoffe
Pharmazeutisch aktive Stoffe 3D-Datenbank pharmazeutisch aktiver Stoffe: >400
Geruchsdatenbank ca. 50 Riechstoffe in 3D
RasMol-Homepage 3D-Datenbank biochem. Stoffe: Proteine, DNA usw.
Dr. Robert J. Lancashire, Jamaica verschiedene 3D-Modelle PDB-Format
Mathmol 3D-Datenbank biochemischer Stoffe
Moleküle des Monats (Bristol) verschiedene spezielle org. Stoffe in 3D
Atomorbitale 3D-Tutorial (Chime)
Aminosäuren 3D-Datenbank der biolog. Wichtigen Aminosäuren
SWISS-Image 3D-Datenbank (Proteine etc)
Makromolekulares Museum 3D-Datenbank (As, Proteine, DNA, Viren etc)
Image Gallery Biomoleküle Jena 3D-Datenbank (As, Proteine, DNA)
Klassische Chem. Reaktionen Datenbank chem. Reaktionen
ChemExper Stoffdatenbank
ChemCom Stoff- und Strukturdatenbank
Physics resources databank Physikalische Eigenschaften und Konstanten
Biokatalysen Datenbank University of Minnesota (>1000 Reaktionen, Stoffe usw)
 
Experimente
Experimentalchemie.de/ schöne Seite zur Experimentalchemie
Chemieexperimente.de Experimente zur Schulchemie
Chemieexperimente.de Experimente zur Schulchemie
   
Reaktionen/Animationen
Glycolyse I; II; III; versch. Animationen
Gärung Animation
Citratzyklus interaktive Animation
Atmungskette Animation
Beta-Oxidation Animation
Kohlenhydratstoffwechsel Animation
Organische Reaktionen chemische Reaktionen organischer Stoffe
Chem. Reaktionen/Stöchiometrie
Chemische Reaktionen Animationen und Tutorials
Rhodopsin Animation
Häm und Eisen
Intermediärstoffwechsel interaktive Animation
Zellstoffwechsel interaktive Animation
Insulin/Glucagonwirkung Animation/Lernprogramm
AchE-Inhibition Animation
Chemie der Drogenwirkung Animation und Lernprogramm
Stoffwechsel Alle wichtigen Stoffwechselwege in 2D+3D
Harnstoffzyklus und N-Stoffwechsel Lernprogramm
Alles zu Metabolismus/Biochemie Linkliste Biochemie
Stoffwechselwege verschiedene Animationen
Alles zu Biochemie Lernprogramm
Linkliste Biochemie
Lipide und Membranen Animation
Interaktive Biochemie Linkliste und Animationen
ATP-Synthase Animation
Bakterienstoffwechsel verschiedene Animationen

Themen/Tutorials
Thermodynamik Tutorial Susanne Metzger
Säure-Base-Tutorial (Englisch)
Tutorial organ. Chemie (Englisch)
Tutorial organ. Chemie (Englisch) Michigan State University
Tutorial organ. Chemie (Englisch) Uni North Carolina
Chemiluminiszenz-Homepage (Englisch)
Säure/Base Titration Interaktive Simulation
Tutorial Allgem. Chemie (Englisch) Uni Alberta
Aledyde und Ketone (Englisch) Washington State University
Reaktionen mit Aldehyden und Ketonen Norh Lake College (Englisch)
Elektrophile Addition (Englisch)
Elektrophile Addition Uni Paderborn
Alkane, Alkene, Alkine, cis/trans ... Bluffton College (Englisch)
Tutorial Organ. Chemie (Englisch) Portland State Uni
Tutorial Chemie (Englisch) Spitzen- Tutorial von Warwick R Bailey
Tutorial Chemie (Englisch) Spitzen- Tutorial von SparkNotes

Chemie-Links
http://www.schulchemie.de/index.htm
Alles über Schulchemie
http://www.seilnacht.tuttlingen.com/
Chemieseite von Th. Seilnacht
http://www.chemieexperimente.de/
Chemieexperimente
http://alp.dillingen.de/projekte/cii/chempge/chem1.htm
Schulchemie
http://www.chemie.uni-ulm.de/experiment/archiv.html Experiment des Monats

1 .http://www.chemie.uni-ulm.de/experiment/lit.html
2. http://www.anachem.umu.se/cgi-bin/pointer.exe?Courses
3. http://www.csun.edu/~vceed002/chem.html
4. http://home.ptd.net/~swenger/

Linkliste Chemie1
Linkliste Chemie2
Linkliste Chemie3
Linkliste Chemie4

http://www.uni-bayreuth.de/departments/didaktikchemie/ Unterrichtsmaterialien Uni Bayreuth
http://www.uniterra.de/
PSE
http://educeth.ethz.ch/chemie/diverses/
Unterrichtsmaterialien der Uni Zürich
http://www.chemie.de/~knecht/
Die Homepage für Chemiker
http://www.claessen.net/chemistry/
Chemie Index
http://www.chemlin.de/
ChemLin
Alles zur Chemie
http://www.chemie.de/
Chemie-Portal
http://www.chemie.uni-halle.de/allg/chemikalien.html
Chemikalienliste
http://members.tripod.de/stuhli/links.html
Links Prof. Stuhlpfarrer
http://chemwww.byu.edu/ora/
Animation organ. Reaktionen
http://www.cem.msu.edu/~parrill/
Linkliste org. Chemie Uni Memphis
 
Ernährungslehre-Links    
http://www.nutriinfo.de
Alles über Ernährung:
Justus v. Liebig Uni Giessen
http://www.uni-hohenheim.de/~wwwin140/info/info.htm
Alles über Ernährung:
Uni Hohenheim
http://focus.de/D/DG/DGD/DGD04/dgd04.htm   Ernährung FOCUS
http://home.t-online.de/home/gerhard_reuter/kel.htm   Ernährung Kinder und Jugendlicher
http://www.bier.de/   Alles über Bier
http://pro.agrar.hu-berlin.de/cdrom/bmelf/bml/bml.htm   BML
http://www.pharmacon.net/praxis/px-nutri.htm   Ernährung und Krankheit
http://www.verbraucherzentrale.de/ernaehrungindex.html   Verbraucherzentrale BW
http://www.vfed.de/   VFED
http://www.dge.de/Pages/navigation/index.html
DGE
http://www.aid.de/aid.htm
Zeitschrift AID

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